Diferansiyel olarak ifade edilen genlerin entegre analizi yumurtalık kanserinin ilerlemesinde rol oynar
PDF
Atıf
Paylaş
Talep
Araştırma
CİLT: 20 SAYI: 4
P: 275 - 284
Aralık 2023

Diferansiyel olarak ifade edilen genlerin entegre analizi yumurtalık kanserinin ilerlemesinde rol oynar

Turk J Obstet Gynecol 2023;20(4):275-284
1. Kocaeli University Faculty of Health Sciences, Department of Medical Genetics and Molecular Biology, Kocaeli, Turkey
2. Kocaeli University Faculty of Medicine, Department of Medical Genetics, Kocaeli, Turkey
Bilgi mevcut değil.
Bilgi mevcut değil
Alındığı Tarih: 18.09.2023
Kabul Tarihi: 13.11.2023
Yayın Tarihi: 08.12.2023
PDF
Atıf
Paylaş
Talep

ÖZET

Amaç:

Yumurtalık kanseri, tedavi çabalarına rağmen yüksek morbiditeye sahip olup ve genellikle kötü prognoz ile ilişkili yaygın bir jinekolojik malignite olarak bilinmektedir. Çalışmamızda, gen ekspresyon farklılıklarının ve moleküler yolakların yumurtalık kanseri gelişimi ve ilerlemesindeki rolünün araştırılması amaçlanmıştır.

Gereç ve Yöntemler:

Çalışmaya yüz otuz üç yumurtalık kanseri ve 34 normal yumurtalık dokusu örneği Gene ExpressionOmnibus veri tabanından indirilerek dahil edilmiştir. Tüm evrelerde diferansiyel olarak ifade edilen genleri (DEG’ler) elde etmek için GeneSpring Yazılımı tümör ve normali karşılaştırarak kullanıldı. DEG’ler, Kyoto Genler ve Genomlar Ansiklopedisi yolak analizi için DAVID arayüzü kullanılarak analiz edilmiştir. Her evredeki merkezi genler, Cytoscape yazılımındaki STRING uygulaması kullanılarak en fazla bağlantıya sahip 15 gen şeklinde belirlenmiştir.

Bulgular:

Diferansiyel olarak ifade edilen genler, hücre döngüsü ve herpes simpleks virüs enfeksiyonu yolakları ile ilişkili bulunmuştur. Toplam 19 gen (ACTB, AKT1, ALB, CTNNB1, EGFR, EP300, ESR1, FN1, GAPDH, HSPA4, IL6, JUN, MYC, PTEN, RPS27A, SRC, TNF, TP53 ve UBC) merkezi genler olarak saptanmıştır. Merkezi genler arasında TP53 geninin tüm evrelerde en yüksek düzeyde bağlantıya sahip olduğu bulunmuştur. EGFR, RPS27A ve AKT1’in sırasıyla evre II, evre III ve evre IV’te yüksek sayıda bağlantıya sahip olduğu dikkati çekmiştir.

Sonuç:

Bu çalışmanın sonuçları over kanseri patogenezine ilişkin literatüre yeni bilgiler katabilir ve potansiyel prognostik ve terapötik hedefler önerebilir.

Anahtar Kelimeler:
Yumurtalık kanseri, gen ekspresyonu, merkezi genler, entegre analiz